（1）食品加工废水中含有大量病原体和微生物，这些病原体微生物的特点是数量大、分布广、存活时间长、繁殖速度快、适应能力强、能产生抗性、会引起人体疾病。
（2）食品加工废水是一种普遍的污染危害，会阻碍人的正常呼吸，导致精神烦躁不安，工作效率降低，记忆力下降，长期生活在这种环境，会导致神经损害。
（3）废水长时间渗入地下，使地下水中的硝态氮和亚硝态氮浓度增高，地下水溶解氧含量减少，有毒成分增多，导致水质恶化，严重威及周边生活用水的水质，高浓度污水还可以导致土壤空隙堵塞，造成土壤透气，透水性下降及板结、盐化，严重降低土壤质量，甚至伤害农作物，造成农作物生长受阻或死亡。
（4）食品工业原料广泛，制品种类繁多，排出废水的水量、水质差异很大。这些原因导致食品工业废水的特点是有机物质和悬浮物含量高，易腐败。
（5）这些废水的危害主要使水体富营养化，已致引起水生生物和鱼类死亡，促使水底沉积的有机物产生臭味，恶化水质，污染环境。
食品加工废水中的主要污染物：
①原料清洗工段，漂浮在废水中固体物质，如菜叶、果皮、碎肉、禽羽等，使废水中含大量悬浮物
②生产工段，原料中很多成分在加工过程中不能全部利用，未利用部分进入废水，使原料中含有夹杂的泥沙及其他有机物等
③成形工段，为增加食品色、香、味，延长保存期，使用了各种食品添加剂，一部分流入废水，成为了溶解在废水中的酸、碱、盐、糖类等，化学成分复杂。
④原料夹杂的泥沙及其他有机物等，悬浮在废水中的物质有油脂、蛋白质、淀粉、胶体物质等
⑤致病菌毒等
食品加工废水的水量特征：
（1）生产随季节变化，废水水质水量也随季节变化
（2）废水量大小不一，食品工业从家庭工业的小规模到各种大型工厂，产品品种繁多，其原料、工艺、规模等差别很大
（3）食品工业废水中可降解成分多，对于一般食品工艺，由于原料来自于自然界有机物质，其废水的成分也以自然有机物质为主，不含有毒物质，生物降解性好。
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